小事(c)PxB-Cy3探針(綠色)和Vanco-Cy5探針(紅色)分別靶向標(biāo)記小鼠腸道菌群的陰性菌和陽性菌。(d)或者利用遺傳操作工具使腸道細(xì)菌表達(dá)熒光蛋白、精之精熒光素酶或者氣泡,來對(duì)腸道細(xì)菌進(jìn)行熒光成像或超聲成像。接下來,為杠詳細(xì)討論了,基于代謝標(biāo)記的非天然糖和穩(wěn)定同位素的成像策略,在不同情景中和多種尺度上對(duì)腸道細(xì)菌進(jìn)行成像。
首先,小事作者總結(jié)了在開發(fā)抗生素衍生的熒光探針方面所做的努力,該探針直接結(jié)合特定的細(xì)菌表面結(jié)構(gòu),以實(shí)現(xiàn)選擇性標(biāo)記不同種類的腸道細(xì)菌。精之精(d)RNA探針代謝標(biāo)記腸道細(xì)菌新合成的RNA。
(b)利用基因工程技術(shù)使大腸桿菌形成充氣的蛋白質(zhì)納米結(jié)構(gòu)(氣泡)來反射超聲波,為杠進(jìn)而超聲成像小鼠體內(nèi)的大腸桿菌。
然后,小事文章介紹了基于核酸染色的細(xì)菌成像,小事使用一般的核酸結(jié)合試劑或選擇性標(biāo)記技術(shù)(例如熒光原位雜交(FISH))來滿足各種應(yīng)用場景中腸道菌群研究的需求。此外,精之精盡管在許多的腸道共生細(xì)菌中進(jìn)行基因操作存在極大的困難,精之精但科學(xué)界最近在利用熒光蛋白和聲響應(yīng)蛋白等報(bào)告基因來改造腸道細(xì)菌方面也做出了巨大的努力。
為杠(b-c)利用代謝寡糖工程(MOE)對(duì)腸道細(xì)菌進(jìn)行成像。文獻(xiàn)鏈接:小事ImagingCommensalMicrobiotaandPathogenicBacteriaintheGut,Acc.Chem.Res.,?2021,DOI:10.1021/acs.accounts.1c00068本文由材料人學(xué)術(shù)組tt供稿,材料牛整理編輯。
【圖文導(dǎo)讀】Figure1.用于研究腸道細(xì)菌的成像工具主要包括抗生素衍生的熒光探針、精之精代謝標(biāo)記探針、精之精核酸染色探針和基因編碼的報(bào)告基因(a)萬古霉素(Vanco)衍生的熒光探針靶向革蘭氏陽性菌細(xì)胞壁肽聚糖中的D-Ala-D-Ala結(jié)構(gòu),多粘菌素B(PxB)和十三碳素A(TriA)衍生的熒光探針則分別結(jié)合到革蘭氏陰性菌的脂多糖和脂質(zhì)II結(jié)構(gòu)上。為杠(e)TriA-TAMRA(紅色)和Vanco-BODIPY(綠色)分別標(biāo)記小鼠腸道菌群的陰性菌和陽性菌。
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