1.乙�;揎椇�(jiǎn)介
細(xì)胞是人體基本的結(jié)構(gòu)與功能單位,主要通過蛋白質(zhì)來執(zhí)行復(fù)雜的任務(wù),延續(xù)人體機(jī)能。好比打仗需要不同的兵器,蛋白質(zhì)執(zhí)行不同的任務(wù)需要進(jìn)行不同的“變異”,一旦蛋白質(zhì)“被嫁接”上一種叫“乙�;钡姆肿樱汀氨恍揎棥背闪艘阴;鞍踪|(zhì)。蛋白質(zhì)乙�;冈谝阴;D(zhuǎn)移酶的作用下,在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上添加乙酰基的過程,是細(xì)胞控制基因表達(dá),蛋白質(zhì)活性或生理過程的一種機(jī)制。揭開蛋白質(zhì)“乙酰化修飾”機(jī)理機(jī)制,將為研究蛋白質(zhì)修飾規(guī)律打下重要基礎(chǔ)。
研究者發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)乙�;揎梾⑴c包括轉(zhuǎn)錄調(diào)控、信號(hào)通路調(diào)控、代謝調(diào)控、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性調(diào)控以及病原微生物感染調(diào)控等多個(gè)重要生理功能。蛋白質(zhì)中的賴氨酸乙酰化修飾還調(diào)控蛋白質(zhì)的多種性質(zhì),包括DNA-蛋白質(zhì)相互作用、亞細(xì)胞定位、轉(zhuǎn)錄活性、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等,除了以上這些重要的生物學(xué)功能外,賴氨酸乙�;鞍踪|(zhì)及其調(diào)控酶與衰老和重大疾�。ㄈ绨┌Y、神經(jīng)變形紊亂、心血管疾病等)緊密相聯(lián)。
2. 調(diào)控乙�;揎椀拿负凸w
要對(duì)某種修飾的機(jī)理和變化進(jìn)行研究,就必須了解調(diào)控修飾的酶和供體,對(duì)于乙�;揎梺碚f,它的供體既是乙酰輔酶A,也是細(xì)胞生理生化代謝中核心TCA循環(huán)中關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。調(diào)控乙�;揎椀拿钢饕譃橐阴^D(zhuǎn)移酶和去乙�;福�
(1)組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(Histoneacetyltransferases,HATs)
組蛋白乙�;竿ㄟ^對(duì)組蛋白賴氨酸殘基進(jìn)行乙�;揎�,減弱DNA與組蛋白之間的相互作用,輔助激活基因轉(zhuǎn)錄。組蛋白乙�;钢饕譃橐韵聨最悾�
① P300/CBP 家族: 如 p300, CBP。
② SRC/p160 核受體共激活家族: 例如 NCOA1, NCOA3。
③ GCN5 家族: 比如 KAT2a, KAT2b等。
④ MYST (SAS/MOZ) 家族: 如 MYST1, Kat5, MYST2, MYST3, MYST4等。
(2)組蛋白去乙�;福℉istone deacetylases,HDACs)
組蛋白去乙�;钢饕袚�(dān)組蛋白乙酰化修飾的清除,輔助抑制基因轉(zhuǎn)錄。它們一般均包含一個(gè)催化去乙�;慕Y(jié)構(gòu)域。一般參與組成多重復(fù)合物。HDACs主要被分為四類:① HDAC 1, 2, 3和 8;② HDAC 4, 5, 7 和9,以及HDAC 6 和10;③ SIRT1 -7;④ HDAC 11。
3.目前乙�;揎椊M學(xué)研究策略
(1)定性
利用可以純化乙酰化底物的抗體A富集并利用高通量質(zhì)譜檢測(cè),該方案具有高靈敏度及高特異性。
(2)定量
① SILAC修飾定量:結(jié)合SILAC標(biāo)記技術(shù)和蛋白質(zhì)修飾抗體富集技術(shù)相結(jié)合,對(duì)細(xì)胞樣本中乙酰化修飾進(jìn)行相對(duì)定量。
②iTRAQ/TMT修飾定量:將iTRAQ/TMT蛋白定量技術(shù)和蛋白質(zhì)修飾富集技術(shù)相結(jié)合,可對(duì)2-10種生物樣本中乙�;揎椷M(jìn)行相對(duì)定量
③非標(biāo)(Label-free)修飾定量:將非標(biāo)(Label-free)定量技術(shù)用于蛋白質(zhì)翻譯后修飾的相對(duì)定量,無需穩(wěn)定同位素標(biāo)記試劑且定量受樣本數(shù)量限制。該技術(shù)目前已成功應(yīng)用于乙�;�、磷酸化等修飾的定量,并且也能夠用于組織樣本中的泛素化定量,解決組織樣本中泛素化修飾無法定量的難題(iTRAQ/TMT技術(shù)無法用于泛素化的定量)。但是由于實(shí)驗(yàn)平行性要求高,沒有上訴標(biāo)記方法定量準(zhǔn)確性高。
④穩(wěn)定同位素二甲基標(biāo)記修飾定量:將利用甲醛和氰基硼氫化鈉組合標(biāo)記肽段N端和賴氨酸側(cè)鏈的氨基。通過同位素標(biāo)記導(dǎo)致的質(zhì)量偏差,進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析。
牛啟生物團(tuán)隊(duì) 高質(zhì)量基金課題推薦合作:
研究方向:SPANXB1 + 乳腺癌 + 機(jī)制研究
課題名稱:SPANXB1競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合●●細(xì)胞鐵死亡●●三陰性乳腺癌●●研究
創(chuàng)新性:★★★★☆
可行性:★★★★★
前沿性:★★★★☆
研究方向:線粒體自噬 + BMP6信號(hào)分子 + 干燥綜合征
課題名稱: 針炙●●線粒體自噬●●干燥綜合征●●機(jī)制研究
創(chuàng)新性:★★★★☆
可行性:★★★★☆
前沿性:★★★★★
研究方向:NEDD4L + 糖基化 + 心肌肥厚
課題名稱:●●NEDD4L●●糖基化逆轉(zhuǎn)銅死亡●●心肌肥厚●●作用
創(chuàng)新性:★★★★☆
可行性:★★★★★
前沿性:★★★★☆
研究方向:人參皂苷Rg1 + 子宮內(nèi)膜損傷后修復(fù) + 作用研究
課題名稱:人參皂苷Rg1●●可變剪接●●子宮內(nèi)膜損傷后修復(fù)的作用研究
創(chuàng)新性:★★★★☆
可行性:★★★★☆
前沿性:★★★★★
更好高質(zhì)量醫(yī)學(xué)臨床基金課題合作,請(qǐng)與我們聯(lián)系合作。